Friday, 21 February 2014

Track Gabon's forests on Global Forest Watch

Francais
L’Institut des Ressources Mondiales a lancé « l’Observatoire des Forêts Mondiales » (Global Forest Watch), une veille interactive en ligne et un système d’alerte qui permet aux personnes de suivre les changements dans le couvert végétal et recevoir des alertes mensuelles lorsque les forêts disparaissent à un endroit donné. Il utilise les mêmes données de changements forestiers globaux qui avaient été publiées par les chercheurs de l’université de Maryland, ainsi que d’autres données telles que les cartes de référence de Saatchi des stocks mondiaux de carbones et les alertes d’incendies de MODIS. Les utilisateurs peuvent télécharger les statistiques des pays sur le couvert et les pertes de forêts, et superposer les concessions minières et forestières ou les aires protégées sur les données des pertes de forêts pour aider à identifier les moteurs de la déforestation. Selon le site web, le Gabon a perdu 189.000 ha de forêt depuis 2000, à un taux moyen de 14.500 ha/an. C’est très faible à une échelle globale, mais lorsque l’on voit que la RDC a perdu presque 6 millions d’hectares pendant la même période, ceci vient encore mettre en lumière l’état critique dans lequel se trouvent les forêts du bassin du Congo. Il est intéressant de noter que les cartes illustrent très clairement comment la plupart de la déforestation au Gabon se fait dans les zones de développements urbains et le long des routes, au lieu que cela soit à l’intérieur des concessions forestières.

 
Map created from Global Forest Watch showing forest loss in Gabon from 2000-2012 (purple), protected areas (grey) and logging concessions (yellow).

English
The World Resources Institute has launched Global Forest Watch, an interactive online forest monitoring and alert system that allows people to track changes in forest cover and receive monthly alerts when forests are lost in a particular area. It uses the same Global Forest Change data-set that was published by researchers at the University of Maryland, as well as other data-sets such as Saatchi's benchmark map of global carbon stocks and MODIS fire alerts. Users can download country statistics on forest cover and forest loss, and overlay logging and mining concessions or protected areas over forest loss data to help identify drivers of deforestation. According to the website, Gabon has lost 189,000 ha forest since 2000, at an average rate of 14,500 ha/year. This is very low on a global scale, but when you see that DRC lost almost 6 million hectares during the same time, this only serves to highlight what a critical state the Congo Basin's forests are in. Interestingly, the map illustrates very clearly how most of the deforestation in Gabon is occurring in areas of urban development and along roadsides, rather than inside logging concessions. 

The site has multiple language options and can be navigated in French. For more advanced users, the data can be downloaded and analysed using Earth Engine (as for Global Forest Change).

Related blogposts:
Global Forest Change data now available for download and analysis.
High resolution Global Forest Change map available online

Global biodiversity maps available online

Francais
Les cartes de la biodiversité mondiale sont disponibles à biodiversitymapping.org, un nouveau site web mis en place pour partager les résultats d’une étude publiée l’année passée intitulée "Global patterns of terrestrial vertebrate diversity and conservation". Les cartes mondiales de la diversité des oiseaux, des mammifères et des amphibiens au niveau de l’Ordre sont disponibles pour téléchargement au format jpeg, accompagnés des listes des espèces.

English
Maps of the world's biodiversity are available at biodiversitymapping.org, a new website set up to share the results of a study published last year "Global patterns of terrestrial vertebrate diversity and conservation". Global maps of birds, mammals and amphibian diversity at the Order level are available as jpeg downloads, accompanied by species lists. 

Reference (download pdf here)
Jenkins, CN, SL Pimm, LN Joppa (2013) Global Patterns of Terrestrial Vertebrate Diversity and ConservationPNAS 110(28): E2602-E2610. doi: 10.1073/pnas.1302251110 

Thursday, 20 February 2014

Two new species of torrent frog for Monts de Cristal

Francais
La taxonomie des grenouilles africaines des ruisseaux de montagne (Torrent frogs) vient tout juste d’être radicalement refaite dans une nouvelle étude publiée dans le numéro de ce mois du journal Molecular Phylogenetics and Evolution. Se trouvant en Afrique de l’ouest, du centre et de l’est, les grenouilles africaines des ruisseaux de montagnes qui habite les petits cours d’eau clair dans les forêts non-perturbées, ont été regroupées dans le seul genre Petropedetes dans la famille Petropedetidae. De nouvelles analyses, conduites à partir de nombreuses analyses morphologiques et génétiques d’échantillons collectés de toutes les espèces connues, exceptée une, a tout bouleversé. Dans la première phylogénie complète de ce groupe sur l’étendue de son aire de distribution, les auteurs ont trouvé que les groupes de l’ouest, du centre et de l’est sont suffisamment génétiquement divergents pour être classés comme trois genres séparés, avec des espèces potentielles découvertes dans trois clades. De plus, le clade de l’ouest était tellement divergent qu’il ne correspondait à aucune des familles analysées dans le groupe, notamment les « outgroups » Conraua et Phynobatrachidea. Les auteurs ont proposé Odontobatrachus comme un nouveau genre pour le clade de l’Afrique de l’ouest (la famille incertae sedis attendant des études complémentaires), Arthroleptides pour le clade des espèces d’Afrique de l’est, alors que l’Afrique centrale comprend Petropedetes. Pour le Gabon, deux nouvelles espèces putatives ont été détectées dans les Monts de Cristal et une au Cameroun.

Petropedetes cameronensis By Anton Reichenow [Public domain], via Wikimedia Commons
English
The taxonomy of the African Torrent frogs has just had a radical shake-up, in a new study published in this month's Molecular Phylogenetics and Evolution. Ranging across Western, Central and Eastern Africa, the African Torrent frogs, that inhabit clear running streams in undisturbed forests, have been assigned to a single genus Petropedetes in the family Petropedetidae. New analyses, conducted from extensive morphological and genetic analyses from samples collected from all but one of the known species, has turned this on its head. In the first comprehensive phylogeny of this group throughout its range, the authors found that the western, central and eastern groups were genetically divergent enough to be classed as three separate genera, and potential new species were found in all three clades. Furthermore, the western clade was so divergent it didn't fit into any of the family groups analysed, including the out-group taxa Conraua and Phynobatrachidea. The authors proposed Odontobatrachus as a new genus for the West African clade (family incertae sedis awaiting further studies), Arthroleptides for East African species, while Central Africa retains Petropedetes. For Gabon, two putative new species were detected in the Monts de Cristal, and one in Cameroon.

Reference
Barej, M. F., Rödel, M., Loader, S. P., Menegon, M., Gonwouo, N. L., Günther, R., … Schmitz, A. (2014). Light shines through the spindrift – Phylogeny of African torrent frogs (Amphibia, Anura, Petropedetidae). Molecular Phylogenetics and Evolution, 71, 261–273.

Female elephants stick with their relatives

A new study looking at genetic structure and relatedness of forest elephants in Lopé National Park has been published in PLOS One, by our colleagues at the University of Missouri and in collaboration with ANPN.
We know from observational studies that elephant group sizes are small at Lopé (average = 2.5), typically composed of adult females and their offspring, while males are solitary. Although groups containing more than one adult are often seen, associations are temporary and change composition, and groups larger than 6 individuals are rare. Telemetry studies on females have also suggested that they seem to stay in fairly limited home ranges, only occasionally venturing out to make longer journeys elsewhere. This new study adds to our knowledge by looking at how individuals are related at different spatial and temporal scales.
By analyzing DNA from dung samples collected in the north-east of the park, the relationship between genetic similarity and distance was examined at distances up to 15 km and at different temporal scales, and network models were created to look at associations between individuals.
Results from the different tests were inconsistent, showing overall weak genetic structure, with negative structure at 5-10 km and positive genetic structure at 0–5 km, with strongest signals from samples collected within a single day (this also happens to be the distance telemetry studies have shown that elephants never exceed when travelling in a single day). Individuals within groups were significantly more related to each other than to individuals between groups.
While dung sample analysis identified groups of up to 6 individuals together at any one time, network models showed that elephants have a more complex social repertoire, sometimes associating with many more individuals in the population than observations might suggest. Social networks were variable, but up to 22 individuals were found, mostly related females.
This study supports the hypothesis that elephant sociality is formed on a fission-fusion system, typically groups of kin based on matrilines, with some individuals associating with multiple related individuals.  

Reference (download pdf here)
Schuttler, S. G., Philbrick, J. a, Jeffery, K. J., & Eggert, L. S. (2014). Fine-scale genetic structure and cryptic associations reveal evidence of kin-based sociality in the african forest elephant. PloS One, 9(2), e88074.


Tuesday, 18 February 2014

Global Forest Change data now available for download and analysis

Francais
Au mois de Novembre de l’année passée, une équipe de chercheurs de l’université du Maryland, en collaboration avec Google, a lancé " Global Forest Change". Il s’agit d’une carte interactive mondiale gratuite du changement du couvert forestier compilée à partir d’images Landsat de haute résolution (voir le contenu du blog "High resolution Global Forest Change map" accessible sur Internet).
Maintenant, la même équipe met à disposition pour le téléchargement les données brutes. Les utilisateurs peuvent manipuler et analyser les données avec "Google Earth Engine" pour calculer les changements forestiers dans le temps et d’autres statistiques dans une région d’intérêt. Cet outil, qui est totalement gratuit, peut être utilisé par les agences gouvernementales ou les ONG pour détecter les déforestations illégales, suivre les taux de déforestation et la régénération des forêts dans des zones particulières, classer l’occupation des terres et le changement dans l’occupation des terres et développer des estimations des pertes annuelles nationales.
Alors qu’un niveau suffisamment élevé de compétences techniques est requis pour manipuler ces jeux de données afin d’en tirer le maximum, des tutoriels compréhensibles et des supports en ligne sont également fournis. Ainsi, des possibilités sont offertes à un grand nombre d’utilisateurs voulant apprendre de nouvelles compétences des SIG et exploiter les données.

Une telle ressource serait inestimable pour informer le plan national d’aménagement au Gabon, mais également un outil éducationnel fantastique pour les universités

English
In November last year, a team of researchers at Maryland University, in collaboration with Google, launched Global Forest Change, a free, global interactive map of forest cover change compiled from high resolution Landsat images (see blogspot High resolution Global Forest Change map available online).
Now the same team have made the raw data available for download. Users can manipulate and analyse the data with Google Earth Engine to compute forest change over time and other statistics within a region of interest. This tool, which is entirely free of charge, could be used by government agencies or NGO's to detect illegal forest clearance, monitor rates of deforestation and forest recovery in particular areas, classify land cover and land cover change and develop annual national forest loss estimates.
While a fairly high level of technical skill is required to manipulate these data-sets to their full extent, comprehensive tutorials and online support are also provided, opening up possibilities for a whole range of users to learn new GIS skills and exploit the data.
Such a resource could be invaluable for informing national land use planning in Gabon, as well as a great educational tool for universities. 

Tuesday, 11 February 2014

International support for Gabon's fight against ivory trafficking

Recently both China and France followed Gabon's example and made headlines by burning several tonnes of confiscated ivory. 
(see China’s first ‘ivory crush’ signals it may join global push to protect African elephants and En images : 698 défenses d'éléphants réduites en poussière à Paris). This week the UK government is holding an international conference on wildlife crime in London. Gathering together global leaders, including the President of Gabon, it aims to achieve high level political commitment to tackle the illegal wildlife trade. ANPN will be present at the conference, and new initiatives we're undertaking on the ground to fight ivory trafficking will be unveiled. ANPN has recently partnered with the Royal Zoological Society of Scotland and the TRACE Wildlife Forensic Network to develop genetic tools to trace seized ivory to Gabon's poached elephants. TRACE is an international NGO that provides support to governments, scientists and law enforcement agencies in the use of wildlife forensic techniques for tackling wildlife crime. By building international links, and in country capacity to collect, store and process genetic samples, this project will be a pioneering use of applied science for tackling wildlife crime in Gabon.

See the following press articles:
Edinburgh scientists use elephant DNA in poacher fight
Scots scientists battle poachers,
Wildlife CSI Techniques to Protect African Forest Elephants

There is also a very interesting article in the UK's The Telegraph  last week about ANPN and Gabon's fight against ivory trafficking: One man's war on the ivory poachers of Gabon.



Tuesday, 4 February 2014

Articles "Open Access" de la Revue BASE en ligne

Francais
Des articles complets publiés dans le journal BASE (Biotechnologie, Agronomie, Société et Environnement) peuvent être consultés en ligne sur le lien suivant : www.pressesagro.be/base/
Le journal a publié en même temps en français et en anglais dans les domaines des sciences forestières, l’agriculture, l’écologie et l’environnement.

English
Full text articles published in the journal BASE (Biotechnologie, Agronomie, Société et Environnement) can be accessed online at the following link: www.pressesagro.be/base/
The journal publishes in both French and English, in the fields of forestry science, agriculture, ecology and the environment.

Some recent relevant articles include:

Fonton NH., Atindogbe G., Fandohan B., Lejeune P., Ligot G. — Structure spatiale des arbres des savanes boisées et forêts claires soudaniennes : implication pour les enrichissements forestiers, p. 429-440. vol. 16 no 4

Diop D., Mbaye MS., Kane A., Sambou B., Noba K. — Chorologie, écologie et ethnobotanique de certains Ficus L. (Moraceae) au Sénégal, p. 13-24. vol. 16 no 1

Gonnety JT., Assémien EFL., Guéi AM., N'Dri AA., Djina Y., Koné AW., Tondoh JE. — Effet des types d'utilisation des terres sur les activités enzymatiques et les propriétés chimiques du sol dans les zones forestières semi-décidues du centre-ouest de la Côte d'Ivoire (Text in English), p. 478-485.

Biwolé AB., Bourland N., Daïnou K., Doucet JL. — Définition du profil écologique de l'azobé, Lophira alata, une espèce ligneuse africaine de grande importance : synthèse bibliographique et perspectives pour des recherches futures, p. 217-228. vol. 16 no 2

Daïnou K., Doucet JL., Sinsin B., Mahy G. — Identité et écologie des espèces forestières commerciales d'Afrique centrale : le cas de Milicia spp. (synthèse bibliographique), p. 229-241. vol. 16 no 2 

Poligui RN., Mouaragadja I., Haubruge E., Francis F. — La culture du safoutier (Dacryodes edulis [G.Don] H.J.Lam [Burseraceae]) : enjeux et perspectives de valorisation au Gabon (synthèse bibliographique), p. 131-147. vol. 17 no 1 

Michez A., Doucet JL., Dendoncker N., Bouché P., Vermeulen C. — Première description du régime alimentaire de Hippopotamus amphibius L. au Parc National de Loango (Gabon) (Text in English), p. 580-583.

Haurez B., Petre CA., Doucet JL. — Impacts de l'exploitation forestière et de la chasse sur les populations de gorille des plaines de l'Ouest (Gorilla gorilla gorilla) et conséquences pour la régénération forestière (synthèse bibliographique) (Text in English), p. 364-372.

Petre CA., Tagg N., Haurez B., Beudels-Jamar R., Huynen MC., Doucet JL. — Le rôle du gorille des plaines de l'ouest (Gorilla gorilla gorilla) dans la dissémination des graines en forêts tropicales et les implications de son déclin (Text in English), p. 517-526.

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